二者資金來源，轉(zhuǎn)移資金的方法和獲取非法收益的目的不同這些方面不同。二者有區(qū)別但也有聯(lián)系，恐怖融資又是與洗錢相關(guān)聯(lián)的，一部分犯罪收益在清洗后，可以作為恐怖活動的資金，具體的區(qū)別如下:

1.資金來源的區(qū)別：

洗錢活動一定有其相關(guān)聯(lián)的上游犯罪活動存在，沒有上游犯罪產(chǎn)生的犯罪收益，就不會有洗錢活動的存在，即洗錢活動中的清洗對象是犯罪收益。 然而恐怖融資的資金只有一小部分是來源于傳統(tǒng)的犯罪活動。

2.獲取非法收益的目的不同：

洗錢活動的最終目的是讓非法的犯罪所得及其收益獲得表面上的合法性，掩飾、隱瞞或消滅犯罪證據(jù)及追索的線索，但是恐怖融資只是達到某些目標(biāo)的一個手段。

3.轉(zhuǎn)移資金的方法不同：

洗錢的主要途徑是通過金融機構(gòu)，通過強化金融機構(gòu)的反洗錢職責(zé)，特別是實施金融交易報告制度，可以有效地防范洗錢活動。

相反的是，恐怖分子經(jīng)常利用的非正規(guī)的資金轉(zhuǎn)移方式包括大額現(xiàn)金運輸、利用貨幣服務(wù)行業(yè)等。

另外，恐怖融資包括為恐怖活動、恐怖分子和恐怖組織籌措資金，是恐怖主義組織為了籌集保障其生存、發(fā)展、壯大和從事恐怖主義活動所需的資金而進行的資金融通活動。恐怖融資是恐怖主義生存和發(fā)展的前提，沒有資金的支持，恐怖主義也會無法生成下去。